Buku baptis dimulai tahun 1909.  Sejak tahun 1906 umat di 'Meester COrnelis' - kini Jatinegara - dilayani oleh P. Hoevenaars, SJ (dari Katedral) dan di tahun 1919 oleh P. Th. van Swieten, SJ (dari Kramat).  Pada tahun 1920, P. A. Mathijsen, SJ menetap di Matraman.

Gereja sekarang diresmikan tahun 1924 di atas sebidang tanah yang dibeli tahun 1906.  Khotbah diberikan dalam Bahasa Belanda dan Melayu (1931).  Gereja rancangan khas arsitek Ghijssels, diperluas dan dirombak total tahun 2002 dengan mempertahankan tampak mukanya.

Pastor Paroki pertama ialah P. Hoevenaars, SJ (1910); pada tahun 1930 Paroki diserahkan kepada imam-imam Fransiskan; 1942-43 imam Yesuit kembali, 1943-46 Pastor Voogdt dan Moningka, Pr melayani seluruh wilayah selatan sampai Rangkasbitung dan Cipanas; sejak tahun 1953, imam SVD menggembalakan paroki besar ini.

Dari Paroki Matraman dipisahkan: Paroki Santo Antonius - Bidaracina (1939) yang mengembangkan 4 Paroki baru; Paroki Santa Anna - Duren Sawit (1970); dan Paroki Santo Arnoldus - Bekasi (1979) yang mengembangkan 4 Paroki baru.

Sebuah bom dilemparkan ke arah Gereja pada Misa Malam Natal tahun 2000.

Alamat Paroki Matraman:

Jl. Kramat Raya no. 134
Jakarta Pusat
Tel. 858-3782

Wisma Soverdi (komunitas dan prokur Serikat Sabda Allah/SVD)
Jl. Matraman Raya no. 125
Jakarta Pusat

Biara Divina Providentia (komunitas Suster St. Fransiskus, Semarang/OSF dengan sekolah Marsudirini TK, SD, SMP, SMU)
Jl. Matraman Raya no. 129
Jakarta Pusat

Komunitas Puteri Reinha Rosari (PRR)
Jl. Utan Kayu Gang AIII/11
Jakarta Pusat

Komunitas dan Provinsialat Suster Gembala Baik
Jl. Raya Jatinegara Barat no. 122

Jadwal Misa di Paroki Matraman: